实验目的：本研究旨在对全基因组DNA样品进行200-500bp区间内的均一性片段化处理，以提高后续分析的精确性和可靠性。

实验仪器及材料：

1. 实验仪器

本次实验采用三款先进的非接触式超声破碎仪器：小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪以及小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。

2. 实验材料

使用的材料为核酸浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液，确保实验结果的可靠性。

实验步骤：

1. 准备阶段

提前15分钟启动三款仪器的冷水机，并将温度设置为4℃。

2. 样品处理

将每个爱思进品牌的15mLEP管中加入100μL浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。然后将装有样品的15mLEP管分别放入三款仪器的适配器中，其他空余孔位由同样体积的水填充。

3. 程序设置

设置程序：温度保持在4℃，超声工作时间为20秒，间隔时间为10秒，总时长分别为15分钟和20分钟，以便进行二个梯度的比较。

4. 结果检测

程序结束后，通过毛细管电泳检测基因组片段化情况。

实验结果：

1. 小美超声-高通量声波基因组剪切仪

- 程序设置：温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长15分钟，平均片段大小：3100bp

- 程序设置：温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长20分钟，平均片段大小：3001bp

2. bioruptor-非接触式超声破碎仪

- 程序设置：温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长15分钟，平均片段大小：4329bp

- 程序设置：温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长20分钟，平均片段大小：4058bp

3. 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪

- 程序设置：温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长15分钟，平均片段大小：3655bp

- 程序设置：温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长20分钟，平均片段大小：3881bp

4. 实验结果汇总

根据实验结果，当基因组片段在200-500bp区间占比越高，峰图越平缓，表示基因组片段的均一性更佳。在样品及程序设定相同的情况下，bioruptor的非接触式超声破碎仪与小美超声的聚能式超声波DNA打断仪在200-500bp区间占比分别为583%与654%，且其峰图呈陡坡状，说明基因组片段化的均一性较差。相比之下，小美超声的高通量声波基因组剪切仪在200-500bp区间的占比为647%，其峰图呈平缓状，表明基因组片段的均一性更好。

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